Pada policy brief pertama telah dibahas integrasi SISRUTE dengan SIRANAP untuk meningkatkan efektivitas rujukan. Selain itu, juga merekomendasikan peningkatan interoperabilitas organisasi dan pengguna SISRUTE, setelah secara teknis SIRANAP telah terintegrasi di dalam SISRUTE. Namun, Tim AHS dan Dinkes Provinsi DIY juga menemukan pengalaman dan tantangan yang dialami oleh rumah sakit asal rujukan dan rumah sakit tujuan rujukan selama penggunaan SISRUTE. Berdasarkan hasil FGD dan uji penggunaan SISRUTE didapatkan beberapa hasil yang menjadi dasar policy brief kedua berikut.